gene expression omnibus(GEO)からデータを取得(^^)

$ mkdir 110128_GEO      #GSEデータセットファイルを入れるためのディレクトリを作成

$ cd 110128_GEO  　　　　#作ったディレクトリに移動

$ lftp ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/pub/geo/DATA/supplementary/series/GSE13869
cd 成功、cwd=/pub/geo/DATA/supplementary/series/GSE13869                                                     

lftp ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/pub/geo/DATA/supplementary/series/GSE13869> ls
-r--r--r--   1 ftp      anonymous 50933760 Jan 24  2010 GSE13869_RAW.tar
-r--r--r--   1 ftp      anonymous      524 Jan 24  2010 filelist.txt

lftp ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/pub/geo/DATA/supplementary/series/GSE13869> get GSE13869_RAW.tar
50933760 バイト転送済、170 秒経過 (292.6KB/s)                                              

lftp ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/pub/geo/DATA/supplementary/series/GSE13869> quit

$ ls
GSE13869_RAW.tar

$ mkdir GSE13869
$ cd GSE13869
$ tar xf ../GSE13869_RAW.tar
$ ls
GSM349023.CEL.gz  GSM349024.CEL.gz  GSM349025.CEL.gz  GSM349026.CEL.gz  GSM349027.CEL.gz  GSM349028.CEL.gz  GSM349029.CEL.gz  GSM349030.CEL.gz


ちなみに下はGUIからデータをとりとりいった画像