$ sudo apt-get install pymol
さあ、PDBjへ行こう♪♪
GUIにて
http://www.pdbj.org/
を入力
 |
| 説明を追加 |
COX-2 (PDB ID = 5cox)をPDBjよりダウンロードしてみる。
次は、pymolを用いてタンパク質の立体構造を描写してみます(^^)
pdb5cox.ent
をダウンロードして、カレントディレクトリにおいて
$ pymol pdb5cox.ent
H - Hide - everythin (一度すべての表示を消すっていう意味）
とした後
S - Show - cartoon
とすると下のような表示(cartoon)になる。すごくきれい(^^)
さらにcartoonの図にlinesを重ねることもできる。
このままの状態で
S - Show - lines
さらには
L - Label - resudues
とした後、もう一つのwindowの方で、
Display - zoom
ってすれば拡大した絵ができる♪♪
美しすぎるタンパク質＼（○＾ω＾○）／
